Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCK3

Tubg2, Tubulin gamma-2 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg2Q8VCK3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubg2Q8VCK3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubg2Q8VCK3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms