Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH7

Rdh10, Retinol dehydrogenase 10, mousemouse

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Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh10Q8VCH7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Rdh10Q8VCH7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rdh10Q8VCH7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Rdh10Q8VCH7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Rdh10Q8VCH7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Rdh10Q8VCH7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Rdh10Q8VCH7 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Rdh10Q8VCH7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Rdh10Q8VCH7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Rdh10Q8VCH7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Rdh10Q8VCH7 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rdh10Q8VCH7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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