Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT0

Tmx1, Thioredoxin-related transmembrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmx1Q8VBT0 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmx1Q8VBT0 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmx1Q8VBT0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmx1Q8VBT0 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmx1Q8VBT0 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmx1Q8VBT0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmx1Q8VBT0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmx1Q8VBT0 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmx1Q8VBT0 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmx1Q8VBT0 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmx1Q8VBT0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmx1Q8VBT0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmx1Q8VBT0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmx1Q8VBT0 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmx1Q8VBT0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmx1Q8VBT0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmx1Q8VBT0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmx1Q8VBT0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmx1Q8VBT0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmx1Q8VBT0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmx1Q8VBT0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmx1Q8VBT0 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmx1Q8VBT0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmx1Q8VBT0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmx1Q8VBT0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmx1Q8VBT0 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmx1Q8VBT0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmx1Q8VBT0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmx1Q8VBT0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmx1Q8VBT0 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmx1Q8VBT0 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmx1Q8VBT0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmx1Q8VBT0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmx1Q8VBT0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmx1Q8VBT0 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmx1Q8VBT0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmx1Q8VBT0 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmx1Q8VBT0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmx1Q8VBT0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmx1Q8VBT0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmx1Q8VBT0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmx1Q8VBT0 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmx1Q8VBT0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmx1Q8VBT0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmx1Q8VBT0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmx1Q8VBT0 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmx1Q8VBT0 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmx1Q8VBT0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmx1Q8VBT0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmx1Q8VBT0 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmx1Q8VBT0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmx1Q8VBT0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmx1Q8VBT0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmx1Q8VBT0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmx1Q8VBT0 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmx1Q8VBT0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmx1Q8VBT0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmx1Q8VBT0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmx1Q8VBT0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmx1Q8VBT0 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmx1Q8VBT0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmx1Q8VBT0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmx1Q8VBT0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tmx1Q8VBT0 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tmx1Q8VBT0 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tmx1Q8VBT0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmx1Q8VBT0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmx1Q8VBT0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmx1Q8VBT0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmx1Q8VBT0 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmx1Q8VBT0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmx1Q8VBT0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmx1Q8VBT0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmx1Q8VBT0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmx1Q8VBT0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmx1Q8VBT0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmx1Q8VBT0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmx1Q8VBT0 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmx1Q8VBT0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmx1Q8VBT0 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmx1Q8VBT0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmx1Q8VBT0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmx1Q8VBT0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmx1Q8VBT0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmx1Q8VBT0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmx1Q8VBT0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmx1Q8VBT0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmx1Q8VBT0 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmx1Q8VBT0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmx1Q8VBT0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmx1Q8VBT0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmx1Q8VBT0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmx1Q8VBT0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmx1Q8VBT0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmx1Q8VBT0 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmx1Q8VBT0 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmx1Q8VBT0 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmx1Q8VBT0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmx1Q8VBT0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tmx1Q8VBT0 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms