Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Top1mtQ8R4U6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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