Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc58Q8R3Q6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms