Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3P9

Slf1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf1Q8R3P9 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slf1Q8R3P9 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slf1Q8R3P9 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slf1Q8R3P9 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slf1Q8R3P9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slf1Q8R3P9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slf1Q8R3P9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slf1Q8R3P9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slf1Q8R3P9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slf1Q8R3P9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slf1Q8R3P9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slf1Q8R3P9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slf1Q8R3P9 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slf1Q8R3P9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slf1Q8R3P9 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slf1Q8R3P9 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slf1Q8R3P9 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slf1Q8R3P9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slf1Q8R3P9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slf1Q8R3P9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slf1Q8R3P9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slf1Q8R3P9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slf1Q8R3P9 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slf1Q8R3P9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slf1Q8R3P9 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slf1Q8R3P9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Slf1Q8R3P9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slf1Q8R3P9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slf1Q8R3P9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slf1Q8R3P9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slf1Q8R3P9 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slf1Q8R3P9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slf1Q8R3P9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slf1Q8R3P9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slf1Q8R3P9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slf1Q8R3P9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slf1Q8R3P9 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slf1Q8R3P9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slf1Q8R3P9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slf1Q8R3P9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slf1Q8R3P9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slf1Q8R3P9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slf1Q8R3P9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slf1Q8R3P9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slf1Q8R3P9 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slf1Q8R3P9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slf1Q8R3P9 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slf1Q8R3P9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slf1Q8R3P9 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slf1Q8R3P9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slf1Q8R3P9 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slf1Q8R3P9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slf1Q8R3P9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Slf1Q8R3P9 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Slf1Q8R3P9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slf1Q8R3P9 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slf1Q8R3P9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slf1Q8R3P9 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slf1Q8R3P9 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slf1Q8R3P9 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slf1Q8R3P9 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slf1Q8R3P9 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slf1Q8R3P9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slf1Q8R3P9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slf1Q8R3P9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slf1Q8R3P9 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slf1Q8R3P9 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slf1Q8R3P9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slf1Q8R3P9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slf1Q8R3P9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slf1Q8R3P9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slf1Q8R3P9 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slf1Q8R3P9 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slf1Q8R3P9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slf1Q8R3P9 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slf1Q8R3P9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slf1Q8R3P9 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slf1Q8R3P9 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slf1Q8R3P9 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slf1Q8R3P9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slf1Q8R3P9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slf1Q8R3P9 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slf1Q8R3P9 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slf1Q8R3P9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slf1Q8R3P9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slf1Q8R3P9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slf1Q8R3P9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slf1Q8R3P9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slf1Q8R3P9 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slf1Q8R3P9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slf1Q8R3P9 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slf1Q8R3P9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slf1Q8R3P9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Slf1Q8R3P9 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Slf1Q8R3P9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slf1Q8R3P9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slf1Q8R3P9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slf1Q8R3P9 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slf1Q8R3P9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slf1Q8R3P9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms