Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3J4

Mterf3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf3Q8R3J4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mterf3Q8R3J4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mterf3Q8R3J4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mterf3Q8R3J4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mterf3Q8R3J4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mterf3Q8R3J4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mterf3Q8R3J4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mterf3Q8R3J4 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Mterf3Q8R3J4 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mterf3Q8R3J4 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mterf3Q8R3J4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mterf3Q8R3J4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mterf3Q8R3J4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mterf3Q8R3J4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mterf3Q8R3J4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mterf3Q8R3J4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mterf3Q8R3J4 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mterf3Q8R3J4 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mterf3Q8R3J4 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mterf3Q8R3J4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mterf3Q8R3J4 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mterf3Q8R3J4 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mterf3Q8R3J4 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mterf3Q8R3J4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mterf3Q8R3J4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mterf3Q8R3J4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mterf3Q8R3J4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mterf3Q8R3J4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mterf3Q8R3J4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mterf3Q8R3J4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mterf3Q8R3J4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mterf3Q8R3J4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mterf3Q8R3J4 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mterf3Q8R3J4 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mterf3Q8R3J4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mterf3Q8R3J4 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mterf3Q8R3J4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mterf3Q8R3J4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mterf3Q8R3J4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mterf3Q8R3J4 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mterf3Q8R3J4 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mterf3Q8R3J4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mterf3Q8R3J4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mterf3Q8R3J4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mterf3Q8R3J4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mterf3Q8R3J4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mterf3Q8R3J4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mterf3Q8R3J4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mterf3Q8R3J4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mterf3Q8R3J4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mterf3Q8R3J4 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mterf3Q8R3J4 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mterf3Q8R3J4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mterf3Q8R3J4 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mterf3Q8R3J4 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mterf3Q8R3J4 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mterf3Q8R3J4 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mterf3Q8R3J4 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mterf3Q8R3J4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mterf3Q8R3J4 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mterf3Q8R3J4 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mterf3Q8R3J4 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mterf3Q8R3J4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mterf3Q8R3J4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mterf3Q8R3J4 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mterf3Q8R3J4 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mterf3Q8R3J4 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mterf3Q8R3J4 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mterf3Q8R3J4 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mterf3Q8R3J4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mterf3Q8R3J4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mterf3Q8R3J4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mterf3Q8R3J4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Mterf3Q8R3J4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mterf3Q8R3J4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mterf3Q8R3J4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mterf3Q8R3J4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mterf3Q8R3J4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mterf3Q8R3J4 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mterf3Q8R3J4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mterf3Q8R3J4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mterf3Q8R3J4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mterf3Q8R3J4 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mterf3Q8R3J4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mterf3Q8R3J4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mterf3Q8R3J4 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mterf3Q8R3J4 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mterf3Q8R3J4 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mterf3Q8R3J4 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mterf3Q8R3J4 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mterf3Q8R3J4 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mterf3Q8R3J4 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mterf3Q8R3J4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms