Protein–RNA interactions for Protein: Q8R263

Vmn1r198, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r198Q8R263 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r198Q8R263 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r198Q8R263 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r198Q8R263 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r198Q8R263 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r198Q8R263 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r198Q8R263 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r198Q8R263 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r198Q8R263 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r198Q8R263 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r198Q8R263 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r198Q8R263 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r198Q8R263 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r198Q8R263 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r198Q8R263 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r198Q8R263 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r198Q8R263 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r198Q8R263 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r198Q8R263 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r198Q8R263 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r198Q8R263 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r198Q8R263 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r198Q8R263 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r198Q8R263 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r198Q8R263 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r198Q8R263 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r198Q8R263 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r198Q8R263 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r198Q8R263 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r198Q8R263 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r198Q8R263 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r198Q8R263 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r198Q8R263 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r198Q8R263 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r198Q8R263 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r198Q8R263 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r198Q8R263 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r198Q8R263 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r198Q8R263 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r198Q8R263 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r198Q8R263 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r198Q8R263 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r198Q8R263 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r198Q8R263 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r198Q8R263 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r198Q8R263 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vmn1r198Q8R263 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vmn1r198Q8R263 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vmn1r198Q8R263 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vmn1r198Q8R263 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r198Q8R263 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r198Q8R263 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r198Q8R263 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r198Q8R263 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r198Q8R263 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r198Q8R263 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r198Q8R263 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r198Q8R263 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r198Q8R263 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r198Q8R263 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r198Q8R263 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r198Q8R263 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r198Q8R263 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r198Q8R263 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r198Q8R263 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r198Q8R263 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r198Q8R263 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r198Q8R263 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r198Q8R263 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r198Q8R263 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r198Q8R263 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r198Q8R263 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r198Q8R263 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r198Q8R263 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r198Q8R263 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r198Q8R263 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r198Q8R263 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r198Q8R263 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r198Q8R263 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r198Q8R263 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r198Q8R263 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r198Q8R263 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r198Q8R263 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r198Q8R263 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r198Q8R263 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r198Q8R263 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r198Q8R263 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r198Q8R263 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r198Q8R263 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r198Q8R263 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r198Q8R263 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r198Q8R263 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r198Q8R263 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r198Q8R263 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r198Q8R263 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r198Q8R263 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r198Q8R263 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r198Q8R263 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r198Q8R263 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r198Q8R263 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.6 ms