Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CipcQ8R0W1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CipcQ8R0W1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms