Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hecw1Q8K4P8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hecw1Q8K4P8 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hecw1Q8K4P8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hecw1Q8K4P8 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hecw1Q8K4P8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hecw1Q8K4P8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Hecw1Q8K4P8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hecw1Q8K4P8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hecw1Q8K4P8 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hecw1Q8K4P8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hecw1Q8K4P8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hecw1Q8K4P8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hecw1Q8K4P8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hecw1Q8K4P8 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Hecw1Q8K4P8 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Hecw1Q8K4P8 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Hecw1Q8K4P8 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Hecw1Q8K4P8 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Hecw1Q8K4P8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hecw1Q8K4P8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hecw1Q8K4P8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hecw1Q8K4P8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hecw1Q8K4P8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Hecw1Q8K4P8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hecw1Q8K4P8 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hecw1Q8K4P8 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hecw1Q8K4P8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hecw1Q8K4P8 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hecw1Q8K4P8 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hecw1Q8K4P8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hecw1Q8K4P8 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hecw1Q8K4P8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hecw1Q8K4P8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hecw1Q8K4P8 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Hecw1Q8K4P8 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Hecw1Q8K4P8 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Hecw1Q8K4P8 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Hecw1Q8K4P8 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hecw1Q8K4P8 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hecw1Q8K4P8 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Hecw1Q8K4P8 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hecw1Q8K4P8 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hecw1Q8K4P8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hecw1Q8K4P8 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hecw1Q8K4P8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hecw1Q8K4P8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hecw1Q8K4P8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hecw1Q8K4P8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hecw1Q8K4P8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hecw1Q8K4P8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hecw1Q8K4P8 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hecw1Q8K4P8 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hecw1Q8K4P8 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hecw1Q8K4P8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hecw1Q8K4P8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hecw1Q8K4P8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hecw1Q8K4P8 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hecw1Q8K4P8 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Hecw1Q8K4P8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hecw1Q8K4P8 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hecw1Q8K4P8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hecw1Q8K4P8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hecw1Q8K4P8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hecw1Q8K4P8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Hecw1Q8K4P8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hecw1Q8K4P8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hecw1Q8K4P8 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hecw1Q8K4P8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hecw1Q8K4P8 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Hecw1Q8K4P8 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hecw1Q8K4P8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hecw1Q8K4P8 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hecw1Q8K4P8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hecw1Q8K4P8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hecw1Q8K4P8 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hecw1Q8K4P8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hecw1Q8K4P8 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Hecw1Q8K4P8 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hecw1Q8K4P8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hecw1Q8K4P8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hecw1Q8K4P8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hecw1Q8K4P8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Hecw1Q8K4P8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hecw1Q8K4P8 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hecw1Q8K4P8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hecw1Q8K4P8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hecw1Q8K4P8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hecw1Q8K4P8 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Hecw1Q8K4P8 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hecw1Q8K4P8 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hecw1Q8K4P8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hecw1Q8K4P8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hecw1Q8K4P8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hecw1Q8K4P8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Hecw1Q8K4P8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hecw1Q8K4P8 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Hecw1Q8K4P8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hecw1Q8K4P8 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hecw1Q8K4P8 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms