Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vrk3Q8K3G5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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