Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prpf39Q8K2Z2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prpf39Q8K2Z2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms