Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2W3

Txndc11, Thioredoxin domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 948 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Txndc11Q8K2W3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Txndc11Q8K2W3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Txndc11Q8K2W3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Txndc11Q8K2W3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Txndc11Q8K2W3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Txndc11Q8K2W3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Txndc11Q8K2W3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Txndc11Q8K2W3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Txndc11Q8K2W3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Txndc11Q8K2W3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Txndc11Q8K2W3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Txndc11Q8K2W3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Txndc11Q8K2W3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Txndc11Q8K2W3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Txndc11Q8K2W3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Txndc11Q8K2W3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Txndc11Q8K2W3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Txndc11Q8K2W3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Txndc11Q8K2W3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Txndc11Q8K2W3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Txndc11Q8K2W3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Txndc11Q8K2W3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Txndc11Q8K2W3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Txndc11Q8K2W3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Txndc11Q8K2W3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Txndc11Q8K2W3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Txndc11Q8K2W3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Txndc11Q8K2W3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Txndc11Q8K2W3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Txndc11Q8K2W3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Txndc11Q8K2W3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Txndc11Q8K2W3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Txndc11Q8K2W3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Txndc11Q8K2W3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Txndc11Q8K2W3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Txndc11Q8K2W3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Txndc11Q8K2W3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Txndc11Q8K2W3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Txndc11Q8K2W3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Txndc11Q8K2W3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Txndc11Q8K2W3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Txndc11Q8K2W3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Txndc11Q8K2W3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Txndc11Q8K2W3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Txndc11Q8K2W3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Txndc11Q8K2W3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Txndc11Q8K2W3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Txndc11Q8K2W3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Txndc11Q8K2W3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Txndc11Q8K2W3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Txndc11Q8K2W3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Txndc11Q8K2W3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Txndc11Q8K2W3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Txndc11Q8K2W3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Txndc11Q8K2W3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Txndc11Q8K2W3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Txndc11Q8K2W3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Txndc11Q8K2W3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Txndc11Q8K2W3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Txndc11Q8K2W3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Txndc11Q8K2W3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Txndc11Q8K2W3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Txndc11Q8K2W3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Txndc11Q8K2W3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Txndc11Q8K2W3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Txndc11Q8K2W3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Txndc11Q8K2W3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Txndc11Q8K2W3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Txndc11Q8K2W3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Txndc11Q8K2W3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Txndc11Q8K2W3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Txndc11Q8K2W3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Txndc11Q8K2W3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Txndc11Q8K2W3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Txndc11Q8K2W3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Txndc11Q8K2W3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Txndc11Q8K2W3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Txndc11Q8K2W3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Txndc11Q8K2W3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Txndc11Q8K2W3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Txndc11Q8K2W3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Txndc11Q8K2W3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Txndc11Q8K2W3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Txndc11Q8K2W3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Txndc11Q8K2W3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Txndc11Q8K2W3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Txndc11Q8K2W3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Txndc11Q8K2W3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Txndc11Q8K2W3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Txndc11Q8K2W3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Txndc11Q8K2W3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Txndc11Q8K2W3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Txndc11Q8K2W3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Txndc11Q8K2W3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Txndc11Q8K2W3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Txndc11Q8K2W3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Txndc11Q8K2W3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Txndc11Q8K2W3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Txndc11Q8K2W3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Txndc11Q8K2W3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms