Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc12Q8K2L8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc12Q8K2L8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc12Q8K2L8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc12Q8K2L8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc12Q8K2L8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc12Q8K2L8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc12Q8K2L8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc12Q8K2L8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc12Q8K2L8 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc12Q8K2L8 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc12Q8K2L8 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc12Q8K2L8 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc12Q8K2L8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc12Q8K2L8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc12Q8K2L8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc12Q8K2L8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc12Q8K2L8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc12Q8K2L8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc12Q8K2L8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Trappc12Q8K2L8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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Trappc12Q8K2L8 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
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Trappc12Q8K2L8 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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Trappc12Q8K2L8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Trappc12Q8K2L8 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc12Q8K2L8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms