Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2C9

Hacd3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd3Q8K2C9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hacd3Q8K2C9 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hacd3Q8K2C9 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hacd3Q8K2C9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hacd3Q8K2C9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hacd3Q8K2C9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hacd3Q8K2C9 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hacd3Q8K2C9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hacd3Q8K2C9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hacd3Q8K2C9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hacd3Q8K2C9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hacd3Q8K2C9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hacd3Q8K2C9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hacd3Q8K2C9 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hacd3Q8K2C9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hacd3Q8K2C9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hacd3Q8K2C9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hacd3Q8K2C9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms