Protein–RNA interactions for Protein: Q8K214

Scmh1, Polycomb protein SCMH1, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scmh1Q8K214 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scmh1Q8K214 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scmh1Q8K214 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scmh1Q8K214 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scmh1Q8K214 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scmh1Q8K214 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scmh1Q8K214 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scmh1Q8K214 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scmh1Q8K214 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scmh1Q8K214 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scmh1Q8K214 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scmh1Q8K214 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scmh1Q8K214 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scmh1Q8K214 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scmh1Q8K214 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scmh1Q8K214 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scmh1Q8K214 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scmh1Q8K214 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scmh1Q8K214 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Scmh1Q8K214 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scmh1Q8K214 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scmh1Q8K214 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Scmh1Q8K214 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Scmh1Q8K214 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scmh1Q8K214 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Scmh1Q8K214 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Scmh1Q8K214 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Scmh1Q8K214 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scmh1Q8K214 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scmh1Q8K214 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scmh1Q8K214 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scmh1Q8K214 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scmh1Q8K214 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scmh1Q8K214 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scmh1Q8K214 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scmh1Q8K214 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scmh1Q8K214 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scmh1Q8K214 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Scmh1Q8K214 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Scmh1Q8K214 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scmh1Q8K214 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scmh1Q8K214 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scmh1Q8K214 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scmh1Q8K214 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scmh1Q8K214 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scmh1Q8K214 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scmh1Q8K214 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scmh1Q8K214 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scmh1Q8K214 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Scmh1Q8K214 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scmh1Q8K214 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scmh1Q8K214 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scmh1Q8K214 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scmh1Q8K214 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scmh1Q8K214 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scmh1Q8K214 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scmh1Q8K214 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scmh1Q8K214 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scmh1Q8K214 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scmh1Q8K214 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scmh1Q8K214 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scmh1Q8K214 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scmh1Q8K214 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scmh1Q8K214 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scmh1Q8K214 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scmh1Q8K214 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Scmh1Q8K214 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scmh1Q8K214 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scmh1Q8K214 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scmh1Q8K214 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scmh1Q8K214 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scmh1Q8K214 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scmh1Q8K214 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scmh1Q8K214 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scmh1Q8K214 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scmh1Q8K214 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scmh1Q8K214 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scmh1Q8K214 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scmh1Q8K214 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scmh1Q8K214 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scmh1Q8K214 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scmh1Q8K214 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scmh1Q8K214 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scmh1Q8K214 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scmh1Q8K214 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Scmh1Q8K214 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scmh1Q8K214 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scmh1Q8K214 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Scmh1Q8K214 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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Scmh1Q8K214 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scmh1Q8K214 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scmh1Q8K214 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scmh1Q8K214 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms