Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1Y2

Prkd3, Serine/threonine-protein kinase D3, mousemouse

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd3Q8K1Y2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prkd3Q8K1Y2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms