Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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Nek9Q8K1R7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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Nek9Q8K1R7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Nek9Q8K1R7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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Nek9Q8K1R7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nek9Q8K1R7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nek9Q8K1R7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nek9Q8K1R7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
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Nek9Q8K1R7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nek9Q8K1R7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nek9Q8K1R7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nek9Q8K1R7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nek9Q8K1R7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Nek9Q8K1R7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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Nek9Q8K1R7 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nek9Q8K1R7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Nek9Q8K1R7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nek9Q8K1R7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nek9Q8K1R7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nek9Q8K1R7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nek9Q8K1R7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nek9Q8K1R7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nek9Q8K1R7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms