Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1E6

Alkbh3, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh3Q8K1E6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Alkbh3Q8K1E6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms