Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0B2

Lmbrd1, Probable lysosomal cobalamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbrd1Q8K0B2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmbrd1Q8K0B2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmbrd1Q8K0B2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms