Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJC5

Neurl3, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl3Q8CJC5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Neurl3Q8CJC5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Neurl3Q8CJC5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Neurl3Q8CJC5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Neurl3Q8CJC5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Neurl3Q8CJC5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Neurl3Q8CJC5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Neurl3Q8CJC5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Neurl3Q8CJC5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Neurl3Q8CJC5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Neurl3Q8CJC5 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Neurl3Q8CJC5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Neurl3Q8CJC5 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Neurl3Q8CJC5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Neurl3Q8CJC5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Neurl3Q8CJC5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Neurl3Q8CJC5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Neurl3Q8CJC5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Neurl3Q8CJC5 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Neurl3Q8CJC5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Neurl3Q8CJC5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Neurl3Q8CJC5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Neurl3Q8CJC5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Neurl3Q8CJC5 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Neurl3Q8CJC5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Neurl3Q8CJC5 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Neurl3Q8CJC5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Neurl3Q8CJC5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Neurl3Q8CJC5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Neurl3Q8CJC5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Neurl3Q8CJC5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Neurl3Q8CJC5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Neurl3Q8CJC5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Neurl3Q8CJC5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Neurl3Q8CJC5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Neurl3Q8CJC5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Neurl3Q8CJC5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Neurl3Q8CJC5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Neurl3Q8CJC5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Neurl3Q8CJC5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Neurl3Q8CJC5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Neurl3Q8CJC5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Neurl3Q8CJC5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Neurl3Q8CJC5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Neurl3Q8CJC5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Neurl3Q8CJC5 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Neurl3Q8CJC5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Neurl3Q8CJC5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Neurl3Q8CJC5 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Neurl3Q8CJC5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Neurl3Q8CJC5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neurl3Q8CJC5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neurl3Q8CJC5 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neurl3Q8CJC5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neurl3Q8CJC5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neurl3Q8CJC5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neurl3Q8CJC5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neurl3Q8CJC5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neurl3Q8CJC5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neurl3Q8CJC5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neurl3Q8CJC5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neurl3Q8CJC5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neurl3Q8CJC5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neurl3Q8CJC5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neurl3Q8CJC5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neurl3Q8CJC5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neurl3Q8CJC5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neurl3Q8CJC5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neurl3Q8CJC5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Neurl3Q8CJC5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Neurl3Q8CJC5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Neurl3Q8CJC5 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Neurl3Q8CJC5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Neurl3Q8CJC5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Neurl3Q8CJC5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Neurl3Q8CJC5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Neurl3Q8CJC5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Neurl3Q8CJC5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Neurl3Q8CJC5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Neurl3Q8CJC5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Neurl3Q8CJC5 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Neurl3Q8CJC5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Neurl3Q8CJC5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Neurl3Q8CJC5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Neurl3Q8CJC5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Neurl3Q8CJC5 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Neurl3Q8CJC5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Neurl3Q8CJC5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Neurl3Q8CJC5 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Neurl3Q8CJC5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neurl3Q8CJC5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neurl3Q8CJC5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neurl3Q8CJC5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neurl3Q8CJC5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neurl3Q8CJC5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neurl3Q8CJC5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neurl3Q8CJC5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neurl3Q8CJC5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neurl3Q8CJC5 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neurl3Q8CJC5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms