Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHI8

Ep400, E1A-binding protein p400, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,072 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ep400Q8CHI8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ep400Q8CHI8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ep400Q8CHI8 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ep400Q8CHI8 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ep400Q8CHI8 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ep400Q8CHI8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ep400Q8CHI8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ep400Q8CHI8 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ep400Q8CHI8 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ep400Q8CHI8 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ep400Q8CHI8 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ep400Q8CHI8 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ep400Q8CHI8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ep400Q8CHI8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ep400Q8CHI8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ep400Q8CHI8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ep400Q8CHI8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ep400Q8CHI8 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ep400Q8CHI8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ep400Q8CHI8 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ep400Q8CHI8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ep400Q8CHI8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ep400Q8CHI8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ep400Q8CHI8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ep400Q8CHI8 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ep400Q8CHI8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ep400Q8CHI8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ep400Q8CHI8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ep400Q8CHI8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ep400Q8CHI8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ep400Q8CHI8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ep400Q8CHI8 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ep400Q8CHI8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ep400Q8CHI8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ep400Q8CHI8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ep400Q8CHI8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ep400Q8CHI8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Ep400Q8CHI8 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ep400Q8CHI8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ep400Q8CHI8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ep400Q8CHI8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ep400Q8CHI8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ep400Q8CHI8 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ep400Q8CHI8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ep400Q8CHI8 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ep400Q8CHI8 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ep400Q8CHI8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ep400Q8CHI8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ep400Q8CHI8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ep400Q8CHI8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ep400Q8CHI8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ep400Q8CHI8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ep400Q8CHI8 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ep400Q8CHI8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ep400Q8CHI8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ep400Q8CHI8 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ep400Q8CHI8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ep400Q8CHI8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ep400Q8CHI8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ep400Q8CHI8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ep400Q8CHI8 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ep400Q8CHI8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ep400Q8CHI8 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ep400Q8CHI8 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ep400Q8CHI8 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ep400Q8CHI8 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ep400Q8CHI8 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ep400Q8CHI8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ep400Q8CHI8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ep400Q8CHI8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ep400Q8CHI8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ep400Q8CHI8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ep400Q8CHI8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ep400Q8CHI8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ep400Q8CHI8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ep400Q8CHI8 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ep400Q8CHI8 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ep400Q8CHI8 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ep400Q8CHI8 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ep400Q8CHI8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ep400Q8CHI8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ep400Q8CHI8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ep400Q8CHI8 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ep400Q8CHI8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ep400Q8CHI8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ep400Q8CHI8 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ep400Q8CHI8 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ep400Q8CHI8 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ep400Q8CHI8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ep400Q8CHI8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ep400Q8CHI8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ep400Q8CHI8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ep400Q8CHI8 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ep400Q8CHI8 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ep400Q8CHI8 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ep400Q8CHI8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ep400Q8CHI8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ep400Q8CHI8 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ep400Q8CHI8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ep400Q8CHI8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms