Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Upp2Q8CGR7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Upp2Q8CGR7 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms