Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Hpf1Q8CFE2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Hpf1Q8CFE2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hpf1Q8CFE2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Hpf1Q8CFE2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Hpf1Q8CFE2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Hpf1Q8CFE2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Hpf1Q8CFE2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Hpf1Q8CFE2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Hpf1Q8CFE2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hpf1Q8CFE2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms