Protein–RNA interactions for Protein: Q8CF98

Colec10, Collectin-10, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec10Q8CF98 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Colec10Q8CF98 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms