Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramef8Q8CE24 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramef8Q8CE24 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramef8Q8CE24 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramef8Q8CE24 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramef8Q8CE24 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramef8Q8CE24 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramef8Q8CE24 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramef8Q8CE24 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramef8Q8CE24 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramef8Q8CE24 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramef8Q8CE24 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramef8Q8CE24 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramef8Q8CE24 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramef8Q8CE24 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramef8Q8CE24 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramef8Q8CE24 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramef8Q8CE24 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramef8Q8CE24 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramef8Q8CE24 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramef8Q8CE24 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramef8Q8CE24 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramef8Q8CE24 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramef8Q8CE24 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pramef8Q8CE24 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramef8Q8CE24 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramef8Q8CE24 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramef8Q8CE24 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramef8Q8CE24 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramef8Q8CE24 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramef8Q8CE24 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramef8Q8CE24 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramef8Q8CE24 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramef8Q8CE24 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramef8Q8CE24 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramef8Q8CE24 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramef8Q8CE24 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramef8Q8CE24 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramef8Q8CE24 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramef8Q8CE24 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramef8Q8CE24 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramef8Q8CE24 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramef8Q8CE24 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramef8Q8CE24 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramef8Q8CE24 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pramef8Q8CE24 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pramef8Q8CE24 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pramef8Q8CE24 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pramef8Q8CE24 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pramef8Q8CE24 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pramef8Q8CE24 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pramef8Q8CE24 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pramef8Q8CE24 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Pramef8Q8CE24 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Pramef8Q8CE24 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
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Pramef8Q8CE24 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pramef8Q8CE24 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pramef8Q8CE24 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pramef8Q8CE24 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pramef8Q8CE24 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pramef8Q8CE24 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pramef8Q8CE24 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pramef8Q8CE24 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pramef8Q8CE24 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pramef8Q8CE24 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pramef8Q8CE24 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pramef8Q8CE24 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pramef8Q8CE24 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pramef8Q8CE24 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pramef8Q8CE24 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pramef8Q8CE24 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pramef8Q8CE24 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pramef8Q8CE24 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pramef8Q8CE24 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pramef8Q8CE24 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pramef8Q8CE24 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pramef8Q8CE24 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pramef8Q8CE24 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pramef8Q8CE24 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pramef8Q8CE24 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pramef8Q8CE24 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pramef8Q8CE24 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pramef8Q8CE24 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pramef8Q8CE24 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pramef8Q8CE24 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms