Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc17Q8CE13 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc17Q8CE13 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms