Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDG3

Vcpip1, Deubiquitinating protein VCIP135, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vcpip1Q8CDG3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vcpip1Q8CDG3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vcpip1Q8CDG3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms