Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrif1Q8CDD9 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrif1Q8CDD9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrif1Q8CDD9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrif1Q8CDD9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrif1Q8CDD9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrif1Q8CDD9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrif1Q8CDD9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrif1Q8CDD9 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrif1Q8CDD9 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrif1Q8CDD9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrif1Q8CDD9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrif1Q8CDD9 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrif1Q8CDD9 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrif1Q8CDD9 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrif1Q8CDD9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrif1Q8CDD9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrif1Q8CDD9 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrif1Q8CDD9 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrif1Q8CDD9 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrif1Q8CDD9 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrif1Q8CDD9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrif1Q8CDD9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrif1Q8CDD9 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrif1Q8CDD9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrif1Q8CDD9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrif1Q8CDD9 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrif1Q8CDD9 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrif1Q8CDD9 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrif1Q8CDD9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrif1Q8CDD9 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrif1Q8CDD9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrif1Q8CDD9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrif1Q8CDD9 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrif1Q8CDD9 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrif1Q8CDD9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrif1Q8CDD9 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrif1Q8CDD9 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrif1Q8CDD9 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrif1Q8CDD9 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrif1Q8CDD9 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrif1Q8CDD9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrif1Q8CDD9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrif1Q8CDD9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrif1Q8CDD9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrif1Q8CDD9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrif1Q8CDD9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrif1Q8CDD9 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrif1Q8CDD9 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrif1Q8CDD9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrif1Q8CDD9 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrif1Q8CDD9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrif1Q8CDD9 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrif1Q8CDD9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrif1Q8CDD9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrif1Q8CDD9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrif1Q8CDD9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrif1Q8CDD9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrif1Q8CDD9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrif1Q8CDD9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrif1Q8CDD9 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrif1Q8CDD9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrif1Q8CDD9 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrif1Q8CDD9 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrif1Q8CDD9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrif1Q8CDD9 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrif1Q8CDD9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrif1Q8CDD9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrif1Q8CDD9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrif1Q8CDD9 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrif1Q8CDD9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrif1Q8CDD9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrif1Q8CDD9 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrif1Q8CDD9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrif1Q8CDD9 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrif1Q8CDD9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrif1Q8CDD9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrif1Q8CDD9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrif1Q8CDD9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrif1Q8CDD9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrif1Q8CDD9 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrif1Q8CDD9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrif1Q8CDD9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrif1Q8CDD9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrif1Q8CDD9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrif1Q8CDD9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrif1Q8CDD9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lrif1Q8CDD9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrif1Q8CDD9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrif1Q8CDD9 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrif1Q8CDD9 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrif1Q8CDD9 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrif1Q8CDD9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrif1Q8CDD9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrif1Q8CDD9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrif1Q8CDD9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrif1Q8CDD9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrif1Q8CDD9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrif1Q8CDD9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrif1Q8CDD9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms