Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD60

UPF0583 protein C15orf59 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CD60 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Q8CD60 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q8CD60 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q8CD60 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q8CD60 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q8CD60 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q8CD60 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q8CD60 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q8CD60 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q8CD60 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q8CD60 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q8CD60 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q8CD60 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q8CD60 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q8CD60 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Q8CD60 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q8CD60 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q8CD60 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q8CD60 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q8CD60 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q8CD60 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Q8CD60 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q8CD60 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q8CD60 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q8CD60 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q8CD60 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q8CD60 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q8CD60 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q8CD60 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q8CD60 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q8CD60 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8CD60 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8CD60 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8CD60 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8CD60 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8CD60 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8CD60 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8CD60 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8CD60 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8CD60 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8CD60 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8CD60 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8CD60 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8CD60 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8CD60 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8CD60 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8CD60 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8CD60 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8CD60 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8CD60 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q8CD60 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Q8CD60 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q8CD60 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q8CD60 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q8CD60 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Q8CD60 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q8CD60 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q8CD60 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q8CD60 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Q8CD60 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Q8CD60 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Q8CD60 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q8CD60 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q8CD60 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q8CD60 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q8CD60 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q8CD60 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q8CD60 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Q8CD60 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q8CD60 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q8CD60 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Q8CD60 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q8CD60 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q8CD60 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8CD60 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8CD60 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8CD60 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8CD60 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8CD60 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8CD60 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8CD60 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8CD60 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8CD60 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8CD60 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8CD60 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8CD60 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8CD60 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8CD60 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8CD60 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8CD60 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8CD60 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8CD60 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8CD60 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8CD60 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q8CD60 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q8CD60 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q8CD60 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q8CD60 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q8CD60 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q8CD60 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms