Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCI5

Rybp, RING1 and YY1-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RybpQ8CCI5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RybpQ8CCI5 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms