Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nrip1Q8CBD1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nrip1Q8CBD1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nrip1Q8CBD1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms