Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9W1

A430089I19Rik, RIKEN cDNA A430089I19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A430089I19RikQ8C9W1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
A430089I19RikQ8C9W1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
A430089I19RikQ8C9W1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
A430089I19RikQ8C9W1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
A430089I19RikQ8C9W1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
A430089I19RikQ8C9W1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
A430089I19RikQ8C9W1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
A430089I19RikQ8C9W1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
A430089I19RikQ8C9W1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
A430089I19RikQ8C9W1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
A430089I19RikQ8C9W1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
A430089I19RikQ8C9W1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
A430089I19RikQ8C9W1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
A430089I19RikQ8C9W1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
A430089I19RikQ8C9W1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
A430089I19RikQ8C9W1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
A430089I19RikQ8C9W1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
A430089I19RikQ8C9W1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
A430089I19RikQ8C9W1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
A430089I19RikQ8C9W1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
A430089I19RikQ8C9W1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
A430089I19RikQ8C9W1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
A430089I19RikQ8C9W1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
A430089I19RikQ8C9W1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
A430089I19RikQ8C9W1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
A430089I19RikQ8C9W1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
A430089I19RikQ8C9W1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
A430089I19RikQ8C9W1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
A430089I19RikQ8C9W1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
A430089I19RikQ8C9W1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
A430089I19RikQ8C9W1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
A430089I19RikQ8C9W1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
A430089I19RikQ8C9W1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A430089I19RikQ8C9W1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
A430089I19RikQ8C9W1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
A430089I19RikQ8C9W1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
A430089I19RikQ8C9W1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A430089I19RikQ8C9W1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A430089I19RikQ8C9W1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A430089I19RikQ8C9W1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A430089I19RikQ8C9W1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A430089I19RikQ8C9W1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
A430089I19RikQ8C9W1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A430089I19RikQ8C9W1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A430089I19RikQ8C9W1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
A430089I19RikQ8C9W1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
A430089I19RikQ8C9W1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A430089I19RikQ8C9W1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A430089I19RikQ8C9W1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A430089I19RikQ8C9W1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A430089I19RikQ8C9W1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A430089I19RikQ8C9W1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A430089I19RikQ8C9W1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
A430089I19RikQ8C9W1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A430089I19RikQ8C9W1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A430089I19RikQ8C9W1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A430089I19RikQ8C9W1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A430089I19RikQ8C9W1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A430089I19RikQ8C9W1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A430089I19RikQ8C9W1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A430089I19RikQ8C9W1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A430089I19RikQ8C9W1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A430089I19RikQ8C9W1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A430089I19RikQ8C9W1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A430089I19RikQ8C9W1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A430089I19RikQ8C9W1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
A430089I19RikQ8C9W1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A430089I19RikQ8C9W1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
A430089I19RikQ8C9W1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A430089I19RikQ8C9W1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A430089I19RikQ8C9W1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
A430089I19RikQ8C9W1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
A430089I19RikQ8C9W1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A430089I19RikQ8C9W1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A430089I19RikQ8C9W1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
A430089I19RikQ8C9W1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
A430089I19RikQ8C9W1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
A430089I19RikQ8C9W1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
A430089I19RikQ8C9W1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
A430089I19RikQ8C9W1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
A430089I19RikQ8C9W1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
A430089I19RikQ8C9W1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
A430089I19RikQ8C9W1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
A430089I19RikQ8C9W1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
A430089I19RikQ8C9W1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
A430089I19RikQ8C9W1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
A430089I19RikQ8C9W1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
A430089I19RikQ8C9W1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
A430089I19RikQ8C9W1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
A430089I19RikQ8C9W1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
A430089I19RikQ8C9W1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
A430089I19RikQ8C9W1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
A430089I19RikQ8C9W1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
A430089I19RikQ8C9W1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
A430089I19RikQ8C9W1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
A430089I19RikQ8C9W1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
A430089I19RikQ8C9W1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
A430089I19RikQ8C9W1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
A430089I19RikQ8C9W1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
A430089I19RikQ8C9W1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms