Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9M4

Gm5111, Predicted gene 5111, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5111Q8C9M4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5111Q8C9M4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5111Q8C9M4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5111Q8C9M4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5111Q8C9M4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5111Q8C9M4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5111Q8C9M4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5111Q8C9M4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5111Q8C9M4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5111Q8C9M4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5111Q8C9M4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5111Q8C9M4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5111Q8C9M4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5111Q8C9M4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5111Q8C9M4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5111Q8C9M4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5111Q8C9M4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5111Q8C9M4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5111Q8C9M4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5111Q8C9M4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5111Q8C9M4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5111Q8C9M4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5111Q8C9M4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5111Q8C9M4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5111Q8C9M4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5111Q8C9M4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5111Q8C9M4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5111Q8C9M4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5111Q8C9M4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5111Q8C9M4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5111Q8C9M4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5111Q8C9M4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5111Q8C9M4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5111Q8C9M4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5111Q8C9M4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5111Q8C9M4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5111Q8C9M4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5111Q8C9M4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5111Q8C9M4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5111Q8C9M4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5111Q8C9M4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5111Q8C9M4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5111Q8C9M4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5111Q8C9M4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5111Q8C9M4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5111Q8C9M4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5111Q8C9M4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm5111Q8C9M4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5111Q8C9M4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5111Q8C9M4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5111Q8C9M4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5111Q8C9M4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5111Q8C9M4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5111Q8C9M4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5111Q8C9M4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5111Q8C9M4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5111Q8C9M4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5111Q8C9M4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5111Q8C9M4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5111Q8C9M4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5111Q8C9M4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5111Q8C9M4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5111Q8C9M4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5111Q8C9M4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5111Q8C9M4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5111Q8C9M4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5111Q8C9M4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5111Q8C9M4 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5111Q8C9M4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5111Q8C9M4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5111Q8C9M4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5111Q8C9M4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5111Q8C9M4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5111Q8C9M4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5111Q8C9M4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5111Q8C9M4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5111Q8C9M4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5111Q8C9M4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5111Q8C9M4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5111Q8C9M4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5111Q8C9M4 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5111Q8C9M4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5111Q8C9M4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5111Q8C9M4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5111Q8C9M4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5111Q8C9M4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5111Q8C9M4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5111Q8C9M4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5111Q8C9M4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5111Q8C9M4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5111Q8C9M4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5111Q8C9M4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5111Q8C9M4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5111Q8C9M4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5111Q8C9M4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5111Q8C9M4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5111Q8C9M4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5111Q8C9M4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5111Q8C9M4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5111Q8C9M4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms