Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9J3

Spef2, Sperm flagellar protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef2Q8C9J3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spef2Q8C9J3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spef2Q8C9J3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Spef2Q8C9J3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spef2Q8C9J3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spef2Q8C9J3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spef2Q8C9J3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Spef2Q8C9J3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Spef2Q8C9J3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spef2Q8C9J3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spef2Q8C9J3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spef2Q8C9J3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spef2Q8C9J3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spef2Q8C9J3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spef2Q8C9J3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spef2Q8C9J3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spef2Q8C9J3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spef2Q8C9J3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spef2Q8C9J3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spef2Q8C9J3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Spef2Q8C9J3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Spef2Q8C9J3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Spef2Q8C9J3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Spef2Q8C9J3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Spef2Q8C9J3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Spef2Q8C9J3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Spef2Q8C9J3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Spef2Q8C9J3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Spef2Q8C9J3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Spef2Q8C9J3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Spef2Q8C9J3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Spef2Q8C9J3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Spef2Q8C9J3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Spef2Q8C9J3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Spef2Q8C9J3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Spef2Q8C9J3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Spef2Q8C9J3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Spef2Q8C9J3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Spef2Q8C9J3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Spef2Q8C9J3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Spef2Q8C9J3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spef2Q8C9J3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spef2Q8C9J3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spef2Q8C9J3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spef2Q8C9J3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spef2Q8C9J3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spef2Q8C9J3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spef2Q8C9J3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spef2Q8C9J3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spef2Q8C9J3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spef2Q8C9J3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Spef2Q8C9J3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spef2Q8C9J3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Spef2Q8C9J3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spef2Q8C9J3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spef2Q8C9J3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spef2Q8C9J3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spef2Q8C9J3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spef2Q8C9J3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spef2Q8C9J3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spef2Q8C9J3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spef2Q8C9J3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Spef2Q8C9J3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spef2Q8C9J3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spef2Q8C9J3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spef2Q8C9J3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spef2Q8C9J3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spef2Q8C9J3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spef2Q8C9J3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spef2Q8C9J3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spef2Q8C9J3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spef2Q8C9J3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spef2Q8C9J3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spef2Q8C9J3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spef2Q8C9J3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spef2Q8C9J3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spef2Q8C9J3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spef2Q8C9J3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Spef2Q8C9J3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Spef2Q8C9J3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Spef2Q8C9J3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Spef2Q8C9J3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Spef2Q8C9J3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Spef2Q8C9J3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Spef2Q8C9J3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Spef2Q8C9J3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Spef2Q8C9J3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Spef2Q8C9J3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Spef2Q8C9J3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Spef2Q8C9J3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Spef2Q8C9J3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Spef2Q8C9J3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Spef2Q8C9J3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Spef2Q8C9J3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Spef2Q8C9J3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Spef2Q8C9J3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Spef2Q8C9J3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Spef2Q8C9J3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Spef2Q8C9J3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Spef2Q8C9J3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms