Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp20Q8C6M1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Usp20Q8C6M1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Usp20Q8C6M1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp20Q8C6M1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
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