Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnot2Q8C5L3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms