Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sfrp1Q8C4U3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Sfrp1Q8C4U3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms