Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3B8

Rft1, Protein RFT1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rft1Q8C3B8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rft1Q8C3B8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms