Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Tceal9-201ENSMUST00000048687 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Prl7a1-201ENSMUST00000006659 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Gm25109-201ENSMUST00000122474 114 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Gm15074-201ENSMUST00000117603 936 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Tas2r113-201ENSMUST00000079035 930 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 3110062G12Rik-201ENSMUST00000192113 1419 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Gm37863-201ENSMUST00000194911 1457 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Mpv17l-202ENSMUST00000124947 768 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Gm20854-202ENSMUST00000181549 1156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Gm20812-202ENSMUST00000189550 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Gm20239-201ENSMUST00000196610 982 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 4930447F04Rik-201ENSMUST00000033525 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Obp1b-201ENSMUST00000088198 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim35Q8C006 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms