Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY87

Usp47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, mousemouse

Predictions only

Length 1,376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp47Q8BY87 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp47Q8BY87 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp47Q8BY87 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp47Q8BY87 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp47Q8BY87 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp47Q8BY87 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp47Q8BY87 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp47Q8BY87 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp47Q8BY87 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp47Q8BY87 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp47Q8BY87 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp47Q8BY87 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp47Q8BY87 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp47Q8BY87 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp47Q8BY87 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp47Q8BY87 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp47Q8BY87 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp47Q8BY87 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp47Q8BY87 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp47Q8BY87 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp47Q8BY87 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp47Q8BY87 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp47Q8BY87 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp47Q8BY87 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp47Q8BY87 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp47Q8BY87 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp47Q8BY87 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp47Q8BY87 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp47Q8BY87 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp47Q8BY87 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp47Q8BY87 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp47Q8BY87 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp47Q8BY87 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp47Q8BY87 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp47Q8BY87 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp47Q8BY87 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp47Q8BY87 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp47Q8BY87 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp47Q8BY87 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp47Q8BY87 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp47Q8BY87 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp47Q8BY87 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp47Q8BY87 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp47Q8BY87 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp47Q8BY87 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp47Q8BY87 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp47Q8BY87 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp47Q8BY87 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp47Q8BY87 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp47Q8BY87 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp47Q8BY87 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp47Q8BY87 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp47Q8BY87 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp47Q8BY87 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp47Q8BY87 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp47Q8BY87 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp47Q8BY87 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp47Q8BY87 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp47Q8BY87 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp47Q8BY87 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp47Q8BY87 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp47Q8BY87 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp47Q8BY87 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp47Q8BY87 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp47Q8BY87 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp47Q8BY87 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp47Q8BY87 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp47Q8BY87 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp47Q8BY87 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp47Q8BY87 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp47Q8BY87 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp47Q8BY87 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp47Q8BY87 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp47Q8BY87 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp47Q8BY87 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Usp47Q8BY87 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Usp47Q8BY87 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Usp47Q8BY87 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp47Q8BY87 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms