Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXJ2

Trerf1, Transcriptional-regulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trerf1Q8BXJ2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trerf1Q8BXJ2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trerf1Q8BXJ2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trerf1Q8BXJ2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trerf1Q8BXJ2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trerf1Q8BXJ2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trerf1Q8BXJ2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trerf1Q8BXJ2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trerf1Q8BXJ2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trerf1Q8BXJ2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trerf1Q8BXJ2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trerf1Q8BXJ2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trerf1Q8BXJ2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trerf1Q8BXJ2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trerf1Q8BXJ2 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trerf1Q8BXJ2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trerf1Q8BXJ2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trerf1Q8BXJ2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trerf1Q8BXJ2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trerf1Q8BXJ2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trerf1Q8BXJ2 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trerf1Q8BXJ2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trerf1Q8BXJ2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Trerf1Q8BXJ2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trerf1Q8BXJ2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trerf1Q8BXJ2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trerf1Q8BXJ2 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Trerf1Q8BXJ2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trerf1Q8BXJ2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trerf1Q8BXJ2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trerf1Q8BXJ2 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trerf1Q8BXJ2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trerf1Q8BXJ2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trerf1Q8BXJ2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Trerf1Q8BXJ2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trerf1Q8BXJ2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trerf1Q8BXJ2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trerf1Q8BXJ2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trerf1Q8BXJ2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trerf1Q8BXJ2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trerf1Q8BXJ2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trerf1Q8BXJ2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trerf1Q8BXJ2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trerf1Q8BXJ2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trerf1Q8BXJ2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trerf1Q8BXJ2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trerf1Q8BXJ2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trerf1Q8BXJ2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trerf1Q8BXJ2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trerf1Q8BXJ2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trerf1Q8BXJ2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trerf1Q8BXJ2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trerf1Q8BXJ2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trerf1Q8BXJ2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trerf1Q8BXJ2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trerf1Q8BXJ2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Trerf1Q8BXJ2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trerf1Q8BXJ2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trerf1Q8BXJ2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trerf1Q8BXJ2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trerf1Q8BXJ2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trerf1Q8BXJ2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trerf1Q8BXJ2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trerf1Q8BXJ2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Trerf1Q8BXJ2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Trerf1Q8BXJ2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trerf1Q8BXJ2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trerf1Q8BXJ2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trerf1Q8BXJ2 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trerf1Q8BXJ2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms