Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX22

Sall4, Sal-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall4Q8BX22 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sall4Q8BX22 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sall4Q8BX22 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sall4Q8BX22 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sall4Q8BX22 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sall4Q8BX22 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sall4Q8BX22 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sall4Q8BX22 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sall4Q8BX22 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sall4Q8BX22 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sall4Q8BX22 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sall4Q8BX22 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sall4Q8BX22 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sall4Q8BX22 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sall4Q8BX22 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sall4Q8BX22 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sall4Q8BX22 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sall4Q8BX22 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sall4Q8BX22 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sall4Q8BX22 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sall4Q8BX22 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sall4Q8BX22 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sall4Q8BX22 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sall4Q8BX22 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sall4Q8BX22 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sall4Q8BX22 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sall4Q8BX22 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sall4Q8BX22 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sall4Q8BX22 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sall4Q8BX22 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sall4Q8BX22 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sall4Q8BX22 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sall4Q8BX22 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sall4Q8BX22 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sall4Q8BX22 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sall4Q8BX22 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sall4Q8BX22 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sall4Q8BX22 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sall4Q8BX22 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sall4Q8BX22 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sall4Q8BX22 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sall4Q8BX22 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sall4Q8BX22 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sall4Q8BX22 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sall4Q8BX22 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sall4Q8BX22 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sall4Q8BX22 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sall4Q8BX22 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sall4Q8BX22 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sall4Q8BX22 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sall4Q8BX22 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sall4Q8BX22 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sall4Q8BX22 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sall4Q8BX22 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sall4Q8BX22 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sall4Q8BX22 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sall4Q8BX22 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sall4Q8BX22 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sall4Q8BX22 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sall4Q8BX22 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sall4Q8BX22 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sall4Q8BX22 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sall4Q8BX22 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sall4Q8BX22 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sall4Q8BX22 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sall4Q8BX22 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sall4Q8BX22 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sall4Q8BX22 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sall4Q8BX22 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sall4Q8BX22 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sall4Q8BX22 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sall4Q8BX22 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sall4Q8BX22 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sall4Q8BX22 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sall4Q8BX22 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sall4Q8BX22 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sall4Q8BX22 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sall4Q8BX22 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sall4Q8BX22 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sall4Q8BX22 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sall4Q8BX22 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sall4Q8BX22 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms