Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ctdsp2Q8BX07 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Ctdsp2Q8BX07 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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