Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TtpaQ8BWP5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TtpaQ8BWP5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms