Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp38Q8BW70 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp38Q8BW70 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp38Q8BW70 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp38Q8BW70 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Usp38Q8BW70 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp38Q8BW70 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Usp38Q8BW70 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp38Q8BW70 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Usp38Q8BW70 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Usp38Q8BW70 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Usp38Q8BW70 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp38Q8BW70 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp38Q8BW70 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp38Q8BW70 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp38Q8BW70 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp38Q8BW70 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp38Q8BW70 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp38Q8BW70 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Usp38Q8BW70 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp38Q8BW70 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp38Q8BW70 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp38Q8BW70 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp38Q8BW70 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Usp38Q8BW70 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp38Q8BW70 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp38Q8BW70 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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