Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW22

Ss18l1, Calcium-responsive transactivator, mousemouse

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Length 402 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18l1Q8BW22 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ss18l1Q8BW22 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ss18l1Q8BW22 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ss18l1Q8BW22 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ss18l1Q8BW22 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ss18l1Q8BW22 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ss18l1Q8BW22 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ss18l1Q8BW22 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ss18l1Q8BW22 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ss18l1Q8BW22 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ss18l1Q8BW22 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ss18l1Q8BW22 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ss18l1Q8BW22 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ss18l1Q8BW22 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ss18l1Q8BW22 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ss18l1Q8BW22 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ss18l1Q8BW22 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ss18l1Q8BW22 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ss18l1Q8BW22 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ss18l1Q8BW22 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ss18l1Q8BW22 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ss18l1Q8BW22 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ss18l1Q8BW22 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ss18l1Q8BW22 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ss18l1Q8BW22 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ss18l1Q8BW22 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ss18l1Q8BW22 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ss18l1Q8BW22 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ss18l1Q8BW22 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ss18l1Q8BW22 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ss18l1Q8BW22 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ss18l1Q8BW22 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ss18l1Q8BW22 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ss18l1Q8BW22 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ss18l1Q8BW22 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ss18l1Q8BW22 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ss18l1Q8BW22 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ss18l1Q8BW22 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ss18l1Q8BW22 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ss18l1Q8BW22 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ss18l1Q8BW22 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ss18l1Q8BW22 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ss18l1Q8BW22 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ss18l1Q8BW22 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ss18l1Q8BW22 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ss18l1Q8BW22 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ss18l1Q8BW22 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ss18l1Q8BW22 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ss18l1Q8BW22 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ss18l1Q8BW22 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ss18l1Q8BW22 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ss18l1Q8BW22 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ss18l1Q8BW22 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ss18l1Q8BW22 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ss18l1Q8BW22 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ss18l1Q8BW22 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ss18l1Q8BW22 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ss18l1Q8BW22 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ss18l1Q8BW22 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ss18l1Q8BW22 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ss18l1Q8BW22 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ss18l1Q8BW22 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ss18l1Q8BW22 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ss18l1Q8BW22 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ss18l1Q8BW22 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ss18l1Q8BW22 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ss18l1Q8BW22 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ss18l1Q8BW22 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ss18l1Q8BW22 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ss18l1Q8BW22 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ss18l1Q8BW22 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ss18l1Q8BW22 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ss18l1Q8BW22 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ss18l1Q8BW22 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ss18l1Q8BW22 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ss18l1Q8BW22 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ss18l1Q8BW22 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ss18l1Q8BW22 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ss18l1Q8BW22 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ss18l1Q8BW22 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ss18l1Q8BW22 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ss18l1Q8BW22 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ss18l1Q8BW22 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ss18l1Q8BW22 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ss18l1Q8BW22 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ss18l1Q8BW22 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ss18l1Q8BW22 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ss18l1Q8BW22 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ss18l1Q8BW22 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ss18l1Q8BW22 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ss18l1Q8BW22 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms