Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMD6

Tmem260, Transmembrane protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem260Q8BMD6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tmem260Q8BMD6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem260Q8BMD6 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms