Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnrc6bQ8BKI2 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnrc6bQ8BKI2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnrc6bQ8BKI2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnrc6bQ8BKI2 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnrc6bQ8BKI2 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnrc6bQ8BKI2 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnrc6bQ8BKI2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnrc6bQ8BKI2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnrc6bQ8BKI2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnrc6bQ8BKI2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnrc6bQ8BKI2 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnrc6bQ8BKI2 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnrc6bQ8BKI2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnrc6bQ8BKI2 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnrc6bQ8BKI2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnrc6bQ8BKI2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnrc6bQ8BKI2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnrc6bQ8BKI2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnrc6bQ8BKI2 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnrc6bQ8BKI2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnrc6bQ8BKI2 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnrc6bQ8BKI2 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnrc6bQ8BKI2 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnrc6bQ8BKI2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnrc6bQ8BKI2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnrc6bQ8BKI2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnrc6bQ8BKI2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnrc6bQ8BKI2 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnrc6bQ8BKI2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnrc6bQ8BKI2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnrc6bQ8BKI2 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnrc6bQ8BKI2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnrc6bQ8BKI2 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnrc6bQ8BKI2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnrc6bQ8BKI2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnrc6bQ8BKI2 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnrc6bQ8BKI2 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnrc6bQ8BKI2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnrc6bQ8BKI2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnrc6bQ8BKI2 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnrc6bQ8BKI2 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms