Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smarcal1Q8BJL0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smarcal1Q8BJL0 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms